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        劉丙強: 單細胞與空間組學數據分析相關算法

        發布時間:2025-09-30
        點擊:
        來源:數學學院

        報告時間2025年10月15日(星期三)9:30

        報告地點數學學院1710室

        報 告 人劉丙強 教授

        工作單位山東大學

        舉辦單位數學學院

        報告簡介

        利用單細胞和空間多組學數據研究生物體生命活動過程以及疾病發生發展過程已成為重要途徑。RNA-seq定量反映樣本的表達水平,為轉錄調控研究奠定了基礎,單細胞多組學測序技術則為刻畫細胞異質性調控提供了方向。進一步,空間組學開創了革命性的方法來理解生物組織的復雜性,它不僅捕捉了基因表達的全景,還保留了至關重要的空間位置信息,使得在細胞乃至亞細胞層面解析組織功能成為現實。

        我們與合作者開發了整合多組學數據的異質圖模型算法以預測細胞類型,特別是稀有細胞類型,進而研究細胞異質性及其調控網絡。同時,我們引入圖信號處理技術,開發了空間組學數據的新表示方法,為表達特征生成可解釋的且融合空間信息的頻域表示,應用于識別空間可變基因、增強基因表達信號、識別功能相關的組織單元等任務。

        進一步,融合基因共表達與空間坐標雙重維度關系的圖傅里葉變換與深度學習框架,設計了新的空間域識別算法,在空間域識別和基因表達信號強化、去噪聲和去批次方面均表現出優異的性能。上述研究將為復雜疾病異質性和調控機制研究提供很好的算法支持。

        報告人簡介

        劉丙強,山東大學數學學院教授、博士生導師、副院長,教育部“長江學者”青年學者。主要從事數學與生物醫學交叉研究。主持國家重點研發計劃、基金委面上項目、山東省杰出青年基金等科研項目。擔任中國運籌學會理事、中國工業與應用數學學會數學生命科學專委會委員、中國數學會生物數學專委會委員、山東數學會副秘書長、山東省生物信息學會副理事長等學術職務

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